Вправе ли заказчик требовать от исполнителя по контракту направлять документы о приемке в «бумажном» виде?

Нет, так как ч. 13 ст. 94 Закона № 44-ФЗ предусматривает предоставление и подписание документов по исполнению контракта в электронном виде