Считается ли госзакупкой выписка из ЕГРН?

Да, считается. Так как расходы по уплате услуг по предоставлению выписок из госреестров относят к виду расходов 244 «Прочая закупка товаров, работ и услуг» и подстатье 226 «Прочие работы, услуги» КОСГУ, то это будет считаться закупкой по Закону № 44-ФЗ. При этом закупку можно провести по пункту 4 или пункту 5 части 1 статьи 93 Закона № 44-ФЗ.